Séquençage shotgun

Carte Commune · n° 429970

En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage « fusil de chasse ») est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on « arrose » tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu. La méthode de terminaison de chaîne du séquençage d'ADN (« méthode de Sanger ») ne peut être utilisée que pour des brins d'ADN courts de 100 à 1 000 paires de bases. En raison de cette limite de taille, les séquences plus longues sont subdivisées en fragments plus petits qui peuvent être séquencés séparément, et ces séquences sont assemblées pour donner la séquence globale. Il existe deux méthodes principales pour ce processus de fragmentation et de séquençage. L'arpentage chromosomique (ou « marche des chromosomes ») progresse sur le brin...

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