Distance de Bray-Curtis

Carte Commune · n° 466656

La distance de Bray-Curtis, ou indice de dissimilarité de Bray-Curtis, est utilisé en écologie et biologie pour évaluer la dissimilarité entre deux échantillons donnés, en termes d'abondance de taxons (phyla, espèces, OTUs...) présents dans chacun de ces échantillons. Il porte le nom de ses auteurs, J. Roger Bray et John T. Curtis. L'indice de Bray-Curtis est souvent appelé à tort une distance (« Une fonction de distance bien définie obéit à l'inégalité triangulaire, mais il existe plusieurs mesures justifiables de la différence entre des échantillons qui n'ont pas cette propriété : pour les distinguer des distances réelles, on les appelle souvent des dissemblances. »). C'est donc parce que l'indice de dissimilarité de Bray-Curtis ne satisfait pas l'inégalité triangulaire qu'on l'appelle dissemblance pour éviter toute confusion. On trouve une implémentation logicielle pour les échantillons de grande taille dans le progiciel mothur. L'indice de dissimilarité de Bray-Curtis est compris entre...

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